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原儿茶酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合 |
洪鑫月周智圣杨晨曦黄德辉杨春华梁恩霞张国文 |
南昌大学食品科学与技术国家重点实验室 |
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摘要 利用荧光光谱法和分子模拟技术,并结合DNA单双链、盐效应、熔点和粘度测量等实验,研究了生理酸度条件下(pH7.4)原儿茶酸与小牛胸腺DNA(ctDNA)的结合性质和结合模式。结果表明,ctDNA能够结合原儿茶酸,并通过静态方式猝灭原儿茶酸的内源荧光,两者的结合常数在103 L·mol-1数量级,氢键和疏水作用是原儿茶酸与ctDNA结合的主要驱动力。原儿茶酸的加入没有明显改变ctDNA的熔点和粘度,单链ctDNA猝灭原儿茶酸荧光的能力大于双链ctDNA,并且NaCl浓度的增加对原儿茶酸-ctDNA复合物的荧光强度没有明显的影响,表明原儿茶酸与ctDNA主要通过沟槽模式结合。分子模拟显示原儿茶酸的结合位点在ctDNA的小沟区,且与碱基胸腺嘧啶(T)形成氢键。分子模拟结果进一步确证了二者之间的沟槽作用模式。
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关键词 :
原儿茶酸,
小牛胸腺DNA,
沟槽结合,
分子模拟
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基金资助:国家自然科学基金资助项目(31460422); 江西省自然科学基金资助项目(20171BAB204029); 食品科学与技术国家重点实验室课题(SKLF-ZZB-201707; SKLF-ZZA-201612); |
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