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| 基于TCGA数据库探索POLA2基因在肝癌中的表达及其与预后的相关性 |
| 阳建超 程兆瑞 喻超 张艾 刘兴贵 |
| 贵州医科大学临床医学院 贵州医科大学附属医院肝胆外科 |
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摘要 目的 探索DNA聚合酶α亚基B（POLA2）在肝癌中的表达，分析POLA2表达与肝癌患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用肿瘤基因组图谱（TCGA）数据库和qRT-PCR技术分析POLA2在肝癌组织及肝癌细胞中的表达水平，利用人类蛋白表达图谱（HPA）数据库评估POLA2蛋白在肝癌组织中的表达水平；应用ROC曲线评估POLA2对肝癌诊断的敏感性，采用Logistic回归分析POLA2表达与肝癌临床病理特征的相关性，通过Kaplan-Meier法、单及多因素Cox回归模型分析POLA2的表达与肝癌患者预后的关系。并进一步寻找TCGA数据库中POLA2共表达基因，进行基因本体（GO）生物功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。同时通过肿瘤免疫评估资源（TIMER）数据库分析POLA2与肝癌免疫浸润的相关性。结果 POLA2在肝癌组织和肝癌细胞中呈显著高表达（均P<0.05）,ROC曲线下面积为0.954。POLA2表达与肝癌TNM分期、组织学分级和临床分期均密切相关（均P<0.01）,单及多变量Cox分析表明高表达的POLA2可作为肝细胞癌（HCC）的独立生物学标志物。GO生物功能及KEGG通路富集分析提示，POLA2基因可能参与保持解旋酶活性和DNA依赖的ATP酶活性，主要富集于细胞周期、DNA复制和范可尼贫血通路。TIMER数据库分析显示POLA2与免疫浸润细胞（Th2细胞、B细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞）具有显著正相关（均P<0.01）。结论 POLA2表达与肝癌患者预后及免疫浸润具有相关性，可作为肝癌诊断及预后评估的重要生物学靶标。
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| 关键词 ：
肝癌,
DNA聚合酶α亚基B表达,
TCGA数据库,
免疫浸润细胞,
预后
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| 基金资助:国家自然科学基金(81860505,81860506)； |
| [1] |
戴志宏李秀丽王晓彤戴懿孙小沛周慧. 心肌桥联因子1在心力衰竭中的研究进展[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(3): 93-. |
| [2] |
程兆瑞 程小平 孙诚谊 喻超. 基于TCGA数据库探索miR-4746-5p在肝癌中的表达及其临床意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(2): 49-. |
| [3] |
邱丽娟周欣. 胎儿腹腔囊性包块的超声声像图特征、包块来源及误诊分析[J]. 实用临床医学, 2022, 23(2): 67-. |
| [4] |
晏毛毛刘宇华蔡珊珊何星星谢步善. 高通量技术筛选的米托蒽醌促进肝癌HepG2细胞凋亡的作用及机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(1): 20-. |
| [5] |
丁亿 熊世达 邓文 何文瑞 郭炬. 基于TCGA数据库分析PODNL1基因在肾透明细胞癌中的表达及临床价值[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(6): 7-. |
| [6] |
程兆瑞 程小平 李福堂 阳建超 孙诚谊 喻超. 微小RNA-4530通过靶向TRIB1抑制肝癌细胞增殖[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(6): 12-. |
| [7] |
刘真 及霄杨 王秀 吴晶晶 王秀丽. 筛选重要生物标志物用于卵巢癌早期诊断和预后评估[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(6): 51-. |
| [8] |
许晶晶宋莹朱佩贾斯达姚懿袁德山赵雪燕李建新高润霖杨跃进徐波袁晋青. 早发急性冠脉综合征合并代谢综合征患者的性别差异及其对PCI术后远期预后的影响[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(5): 3-. |
| [9] |
许晶晶宋莹朱佩贾斯达姚懿袁德山赵雪燕李建新高润霖杨跃进徐波袁晋青. 早发急性冠脉综合征合并代谢综合征患者的性别差异及其对PCI术后远期预后的影响[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(5): 31-. |
| [10] |
方明袁立黄龙. 肺腺癌中免疫相关lncRNA的筛查表达与预后分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 11-. |
| [11] |
邓剑雄钟方炎顾伟国邱峰. 跨膜丝氨酸蛋白酶2与肺腺癌和肺鳞癌预后的关系[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 35-. |
| [12] |
王鑫薛莉崔长富燕飞张妮李转会. 血清miR-23a表达水平与急性脑梗死患者预后的相关性[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 44-. |
| [13] |
钟方炎 邓剑雄 赖军明 沈若妍 林红 罗辉. GINS家族基因在肾透明细胞癌中的表达特点及预后价值[J]. 实用临床医学, 2021, 22(3): 1-. |
| [14] |
陈兰 林远生 刘建生 . 基于TCGA数据库分析TUBA1C在肺腺癌中的表达及临床意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(3): 69-. |
| [15] |
刘荣邵星星耿新普. HERG1在非小细胞肺癌中的表达及其对NF-κB信号通路的影响[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(2): 52-. |
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