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| 基于TCGA数据库探索miR-4746-5p在肝癌中的表达及其临床意义 |
| 程兆瑞 程小平 孙诚谊 喻超 |
| 贵州医科大学研究生院 南昌大学第一附属医院病理科 贵州医科大学附属医院肝胆外科 |
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摘要 目的 探讨miR-4746-5p在肝癌中的表达与临床意义。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取375例肝癌组织与50例癌旁组织RNA-seq数据及对应患者的临床信息，比较其miR-4746-5p表达水平与肝癌患者临床病理特征及预后的相关性；使用单、多因素Cox回归模型评估肝癌患者预后的危险因素；应用ROC曲线评估miR-4746-5p诊断肝癌的敏感性；利用ssGSEA评估miR-4746-5p表达水平与肝细胞癌(HCC)免疫浸润水平的相关性。结果 miR-4746-5p在肝癌组织中的表达显著高于正常肝组织及癌旁组织(P<0.01),并且miR-4746-5p表达水平与肝癌患者TMN分期、组织学水平、甲胎蛋白水平、是否伴血管侵犯及年龄密切相关(均P<0.05)。高表达miR-4746-5p的肝癌患者总生存率与疾病特异性生存期明显低于miR-4746-5p低表达患者(均P<0.05)。TNM分期与miR-4746-5p表达水平是相互独立的影响肝癌患者预后的危险因素(P<0.01)。GO生物功能及KEGG富集分析提示，miR-4746-5p可能参与调节细胞分化、小GTP酶结合活性和轴突部组装等过程，其靶基因主要富集于MAPK信号通路、轴突引导信号通路、自噬信号通路；miR-4746-5p的表达水平与多种免疫细胞浸润水平(如巨噬细胞、Th2细胞、CD8 T细胞、NK细胞、中性粒细胞等)相关。此外，miR-4746-5p可能通过调控ASPG/CXCL12/IGF2/c11orf96/SEC31B轴促进HCC的发生发展并导致不良预后。结论 miR-4746-5p可作为诊断早期肝癌的标志物并对肝癌患者临床治疗及预后预测具有重要意义。
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| 关键词 ：
肝癌,
miR-4746-5p,
癌症基因组图谱数据库,
生物信息
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| 基金资助:国家自然科学基金项目(81860505,81860506)； 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2021]一般080)； |
| [1] |
晏毛毛刘宇华蔡珊珊何星星谢步善. 高通量技术筛选的米托蒽醌促进肝癌HepG2细胞凋亡的作用及机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(1): 20-. |
| [2] |
程兆瑞 程小平 李福堂 阳建超 孙诚谊 喻超. 微小RNA-4530通过靶向TRIB1抑制肝癌细胞增殖[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(6): 12-. |
| [3] |
杜尚广 涂序堂 熊敏 余波 曹文艳 徐雅楠 罗火林. 木薯MeSAD基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2021, 45(4): 377-. |
| [4] |
涂成城陶峰储斌陈红波. 子痫前期相关miR-23b-5p靶基因的预测及生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 1-. |
| [5] |
邓剑雄钟方炎顾伟国邱峰. 跨膜丝氨酸蛋白酶2与肺腺癌和肺鳞癌预后的关系[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 35-. |
| [6] |
钟方炎 邓剑雄 赖军明 沈若妍 林红 罗辉. GINS家族基因在肾透明细胞癌中的表达特点及预后价值[J]. 实用临床医学, 2021, 22(3): 1-. |
| [7] |
李登华. 64排螺旋CT联合磁共振对原发性肝癌的诊断价值[J]. 实用临床医学, 2020, 21(6): 50-. |
| [8] |
谢正元 赖月亮 刘思甫 汤胜兰. 槐耳颗粒逆转肝癌侧群细胞耐阿霉素的实验研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2020, 60(5): 13-. |
| [9] |
王娜 李燕萍. 橙色红曲菌Rab蛋白家族的生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2020, 44(4): 332-. |
| [10] |
万波英莉莉. 经皮肝穿刺瘤内无水乙醇注射治疗无手术机会肝癌2例报告[J]. 实用临床医学, 2020, 21(4): 32-. |
| [11] |
黄宇操张雨薇杨文龙. 血清RASSF1A基因甲基化对原发性肝癌诊断价值的Meta分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2020, 60(2): 68-. |
| [12] |
陈东启余勃陆豫. RACE法克隆黑曲霉NCU-317中α-L-鼠李糖苷酶基因与生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2019, 43(5): 489-. |
| [13] |
周诚忠夏炎春夏海波闻振宇周建平. 体部伽玛刀立体定向放疗联合TACE治疗原发性肝癌合并门静脉癌栓的效果[J]. 实用临床医学, 2019, 20(4): 26-. |
| [14] |
胡大仁刘定志薜浩. miRNA-181c对肝癌细胞增殖的影响及其机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2019, 59(4): 69-. |
| [15] |
何星星谢步善刘建国郭贵海. 高通量技术筛选抑制肝癌细胞生长的新型小分子化合物[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2019, 59(2): 1-. |
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