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| 基于TCGA数据库分析PODNL1基因在肾透明细胞癌中的表达及临床价值 |
| 丁亿 熊世达 邓文 何文瑞 郭炬 |
| 南昌大学研究生院医学部 南昌大学第一附属医院泌尿外科 |
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摘要 目的探讨Podocan样1(PODNL1)基因在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达和临床价值。方法从TCGA数据库下载KIRC患者的PODNL1基因转录本测序数据和临床资料;利用WilCox检验分析比较PODNL1基因在KIRC组织和正常组织样本中的表达;Kaplan-Meier方法分析PODNL1的表达与KIRC患者总体生存率的关系;通过WilCoxon符号秩检验和逻辑回归分析PODNL1基因表达与患者临床病理参数的关系;使用Cox回归分析PODNL1的表达对KIRC患者预后评估的价值;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测PODNL1 mRNA在各细胞系中的表达水平;使用基因富集分析(GSEA)分析PODNL1在KIRC中的作用机制。结果与正常组织相比,PODNL1在KIRC组织中显著上调(P<0.001);Kaplan-Meier分析显示KIRC患者中PODNL1高表达组的总体生存率低于低表达组(P<0.001);PODNL1的表达与KIRC患者的临床病理参数包括肿瘤分级(P<0.001)、临床分期(P<0.001)、肿瘤浸润深度(P<0.001)、淋巴结浸润(P=0.001)、远处转移(P=0.001)呈显著相关。Cox回归分析提示PODNL1是KIRC的独立预后分子。RT-qPCR结果显示PODNL1在KIRC细胞系中高表达(P<0.05);GSEA分析结果显示高表达PODNL1中几条肿瘤相关的信号通路呈富集。结论 PODNL1在KIRC组织中高表达,并与KIRC的恶性进展相关,可能是预测患者预后的分子标记物。
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| 关键词 ：
肾透明细胞癌,
TCGA数据库,
PODNL1,
基因富集分析,
预后
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| 基金资助:国家自然科学基金(81860454)； |
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