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| X射线电离辐射对小鼠心肌转录组的影响 |
| 鹰潭市人民医院心血管内科 鹰潭市人民医院科教科 南昌大学基础医学院组织学与胚胎学教研室 |
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摘要 目的 探讨单次8 Gy X射线局部电离辐射(IR)对小鼠心肌细胞的动态转录调控的分子机制。方法 将C57 BL/6小鼠随机分为IR组和对照组,每组6只。IR组采用8 Gy X射线局部照射小鼠胸部,建立小鼠心脏IR损伤模型。通过转录组测序(RNA-seq)分析IR组IR后第14天(IR-14 d组)、第28天(IR-28 d组)的差异表达基因(DEGs),并与对应时点对照组(CTL-14 d及CTL-28 d)的DEGs进行比较,结合基因本体论(GO)、基因组百科全书(KEGG)富集分析、基因集富集分析(GSEA)及蛋白互作网络(PPI)解析细胞周期、DNA修复和cGAS-STING信号通路的时序性变化及关键调控节点。结果 与对应时点的对照组相比,IR-14 d组和IR-28 d组分别筛选出327个(下调基因占68.5%)和623个(上调基因占64%)DEGs。KEGG分析显示,IR-14 d组差异基因主要富集于免疫系统通路(42个),IR-28 d组则集中于信号转导(69个)及免疫系统通路(64个)。GSEA证实IR-14 d组DNA修复通路负向富集(NES=-1.50 ,P=0.039),而IR-28 d组细胞周期(NES=2.25 ,P<0.001)和cGAS-STING通路(NES=1.57,P=0.016)显著激活。PPI分析发现IR-28 d组核心枢纽蛋白为Cdk1(关联度最高),IR-14 d组关键蛋白为Ifi44。结论 靶向抑制Cdk1复制应激响应及STING依赖性炎症微环境或为防治放疗相关性心脏病提供新策略。
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| 关键词 :
电离辐射,
心肌细胞,
转录组测序,
细胞周期,
Cdk1,
动物,
实验,
小鼠
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| 基金资助:国家自然科学基金地区项目(Z2022095); 江西省引导地方专项鹰潭市科技计划项目(202337-16466); |
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