南昌大学学报(医学版)
 
2025年06月23日 星期一  首页  |  期刊社主页  |  期刊介绍  |  编 委 会  |  征稿启事  |  期刊订阅  |  联系我们
南昌大学学报(医学版)
  基础医学 本期目录 | 过刊浏览 | 高级检索 |
基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因
曾春艳 李俊 陈幼祥
南昌大学第一附属医院消化内科 江西省中西医结合医院消化内科
全文: PDF (0 KB)   HTML (1 KB) 
输出: BibTeX | EndNote (RIS)      
摘要 

目的 了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据。方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠胰腺样本的基因表达谱。使用GEO2R鉴定所有差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并使用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析进行注释。结果 在GSE109227、GSE3644和GSE65146数据集中发现38个共同的DEGs,将其构建成1个蛋白质-蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)网络,确定了枢纽蛋白,并提取了功能模块。通过PPI网络分析确定参与粘连接头通路的3个基因(Cdh1、Iqgap1和Actn4),可能为AP的诊断和治疗提供潜在的生物标志物。结论 Cdh1、Iqgap1和Actn4基因对AP的发生和发展有影响,这可能为AP的诊断和治疗提供新的靶点。

服务
把本文推荐给朋友
加入我的书架
加入引用管理器
E-mail Alert
RSS
作者相关文章
曾春艳 李俊 陈幼祥
关键词 急性胰腺炎差异表达基因GO和KEGG分析蛋白质-蛋白质相互作用生物标志物    
    
基金资助:

江西省卫健委科技计划项目(20203104,2019A046);

引用本文:   
曾春艳 李俊 陈幼祥. 基于整合分析基因表达数据筛选急性胰腺炎中差异表达基因[J]. 南昌大学学报(医学版), 2024, 64(5): 81-.
链接本文:  
https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xbyxb/CN/     或     https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xbyxb/CN/Y2024/V64/I5/81
 

版权所有 © 2011《南昌大学学报(医学版)》编辑部 
本系统由北京玛格泰克科技发展有限公司设计开发 技术支持:support@magtech.com.cn
赣ICP备20001624号-1