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| 基于转录组分析不同温度下池蝶蚌性别相关基因的表达 |
| 南昌大学生命科学学院 南昌大学江西省水产动物资源与利用重点实验室 |
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摘要 采用Pacbio三代和Illumina二代测序技术对不同温度(15℃,20℃,25℃,30℃,33℃)条件下养殖的30月龄池蝶蚌性腺组织进行转录组分析。通过差异分析获得各个温度下雌雄对比组的差异基因,数量分别为6 311,3 013,6 673,6 798和5 685个。其中在20℃和33℃下差异基因数量最少。差异表达基KEGG富集显示,25℃条件下出现卵母细胞的有丝分裂,细胞周期和notch信号通路等雌性相关活动。对五个温度处理组之间的差异表达基因进行组间比较,发现含有802个共同表达差异的基因,其中鉴定到wnt4,rspo1,fem1和tra1等4个性别决定相关基因。在qRT-PCR和转录组数据中,各温度下wnt4,rspo1的表达水平雌性均显著(P<0.01)高于雄性;而fem1,tra1相反。根据wnt4,rspo1,fem1和tra1在不同温度下的相对表达情况和差异基因的KEGG富集结果表明,25℃以上更利于雌性发育,其发育机制还有待深入研究。
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| 关键词 ：
池蝶蚌,
转录组,
性别决定,
性腺,
差异表达基因
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| 基金资助:科技部国家重点研发计划(2018YFD0901400)； 国家自然科学基金资助项目(31660337&31860737)； 国家现代农业产业技术体系(CARS-49)； |
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