|
|
|
| RACE法克隆黑曲霉NCU-317中α-L-鼠李糖苷酶基因与生物信息学分析 |
| 陈东启余勃陆豫 |
| 江西省核工业地质局测试研究中心南昌大学中德联合研究院 |
|
|
|
|
摘要 实验室前期筛选得到一株能够产α-L-鼠李糖苷酶的黑曲霉NCU-317,但由于其完整产酶序列未知,通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术和改良cDNA末端快速扩增(RACE)法,以克隆得到的黑曲霉NCU-317 cDNA为模板,成功克隆得到其α-L-鼠李糖苷酶基因全长。克隆得到α-L-鼠李糖苷酶基因共3 018 bp,其中含有2 748 bp的完整开放阅读框,5’非编码区长为216 bp,3’非编码区长为54 bp。经过对序列的生物信息学分析显示:编码蛋白由915个氨基酸组成,预测理论分子量为103.94 kD,等电点为5.59;蛋白质二级结构以无规则卷曲为主;将氨基酸序列输入UniProt比对后发现,黑曲霉NCU-317的产酶序列与黑曲霉A0A254UAG7同源性最高,达到了99.6%。
|
|
| 关键词 ：
黑曲霉,
α-L-鼠李糖苷酶,
RT-PCR,
RACE,
生物信息学分析
|
|
|
| 基金资助:江西省科技厅重点研发基金资助项目(20171BBF60005)； |
| [1] |
邬子彬胡基志羌宇余勃陆豫. 黑曲霉所产α-L-鼠李糖苷酶制备普鲁宁[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2017, 41(06): 561-. |
| [2] |
黄建伟； 李艳红； 许小明； 郑剑； 刘繁荣； 熊小亮. TLR4在过敏性休克死亡豚鼠中的表达及法医学意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2016, 56(06): 4-. |
| [3] |
梁志林； 王辉； 胡维； 刘志刚； 刘晓宇. 家蚕过敏原细胞视黄酸结合蛋白(CRABP)的克隆表达及生物学分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2016, 56(05): 15-. |
| [4] |
邬子彬； 李大伟； 陆豫. 一株产α-L-鼠李糖苷酶菌株的分析与鉴定[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2016, 40(04): 346-. |
| [5] |
林建立； 巴金戈； 刘志刚； 杨平常； 刘晓宇. 粉尘螨过敏原Derf21的生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2016, 56(03): 1-. |
| [6] |
胡川； 姜伟； 单艳； 聂挺； 余勃； 陆豫. 微生物源α-L-鼠李糖苷酶制备橙皮素单葡萄糖苷[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2016, 40(01): 60-. |
| [7] |
王萍；王静；王建鸿. Embrace树脂水门汀对纵裂牙保存治疗的疗效[J]. 实用临床医学, 2012, 13(09): 80-. |
| [8] |
杨慧；杨斌；孙坚；王农荣；何士勤；周南进；熊跃斌；李剑琦；俞红；冷红文. 双密达莫抑制流感病毒A(H_1N_1)核蛋白基因作用的实验研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2012, 52(08): 13-. |
| [9] |
周怀龙; 黎才海; 李其云; 易波. 乙酰肝素酶mRNA在直肠癌组织中的表达及其临床意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2010, 52(02): 1-. |
| [10] |
罗俊峰; 万炎华; 熊炳贤. Bmi-1在直肠癌中的表达及其临床意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2009, 51(07): 1-. |
| [11] |
刘九思; 王梦龙. 胃癌中Runx3表达及其甲基化[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2009, 51(02): 1-. |
| [12] |
龚辉; 朱水山; 张弘英; 刘海燕; 詹亚平; 杜芳腾. p73β基因对肝癌细胞的影响[J]. 实用临床医学, 2008, 9(10): 1-. |
| [13] |
张华华; 郑克勤. 实时定量RT-PCR评价小鼠胸腺功能和状态方法的建立[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2008, 50(04): 1-. |
| [14] |
曾艳花; 刘小萍. 组织因子途径抑制物-2在胎膜早破中表达的实验研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2008, 50(04): 1-. |
| [15] |
胡庆宏; 易诚予; 刘明珪; 邹志森; 秦克旺; 黎剑. 导入CTLA4Ig基因对肝移植大鼠Fas mRNA表达的影响[J]. 实用临床医学, 2007, 8(10): 1-. |
|
|
|
|
