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| 胞葬相关基因在肝细胞癌中的表达及其预后模型的构建 |
| 史青峰 朱亚丽 周伯宣 俞快 曹玮 熊海蔚 吴紫云 吴佳慧 蔡祥凯 李映良 |
| 南昌大学第一附属医院乳腺专病中心 南昌大学第一附属医院检验科 南昌大学输血医学科 南昌大学第一临床学院 |
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摘要 目的 探讨胞葬相关基因在肝细胞癌（HCC)中的预后价值,构建基于胞葬相关基因的预后风险评估模型。方法 从TCGA数据库获取371个肿瘤及50个正常样本RNA测序与临床数据，经DESeq2筛选差异基因；通过ClusterProfiler进行GO功能及KEGG通路富集分析。结合GeneCards数据库筛选差异胞葬基因，单因素Cox回归识别预后相关基因，ggplot2分析其在HCC与正常组织的表达差异。基于Lasso回归构建风险模型，以中位风险评分分组行Kaplan-Meier生存分析，ROC评估模型准确性；通过单多因素COX回归结合临床特征与风险评分，用rms包构建列线图预测1、3、5年生存率，校准曲线验证可靠性。结果 筛选出2898个差异基因（2452个上调、446个下调）。GO/KEGG分析显示，上调基因富集于核糖核蛋白复合体生物发生、细胞周期调控等，下调基因涉及小分子分解代谢、脂肪酸代谢等。进一步筛选出20个差异表达胞葬基因，单因素Cox回归确定14个预后相关基因，其中9个在HCC中显著升高、5个显著下降（P<0.001）。Lasso分析构建含8个核心基因的风险模型（1、3、5年实际总生存率的AUC分别为0.743、0.694、0.715,P<0.05），结合T/M分期和风险评分构建列线图（1、3、5年预期总生存率的AUC为0.730、0.706、0.730,P<0.05），校准曲线显示预测与实际的生存率一致性较好。结论 生物信息学筛选出的8个胞葬核心基因与HCC预后相关,构建的预后风险评估模型具有一定的使用价值。
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| 关键词 ：
肝细胞癌,
胞葬相关基因,
基因集富集分析,
预后风险评估模型
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| 基金资助:国家自然科学基金资助项目(32100729)； 江西省赣鄱英才计划-创新领军人才项目(gpyc20240199)； 江西省自然科学基金青年项目(20242BAB20404)； 江西省教育厅重点项目(GJJ2400104)； 江西省中医药局一般项目(2024A0090,2024B1251)； 南昌大学第一附属医院全职引进人才经费(RSC-0020)； |
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