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| 草鱼(Ctenopharyngodon idella)长链非编码RNA ISG152-L2激活IRF3和ISG152的表达 |
| 南昌大学生命科学学院 |
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摘要 长链非编码RNA(lncRNA,非编码RNA≥200 bp)以前被认为是转录中的“噪音”。然而，近年来已经发现了相当多的具有重要功能的lncRNA。LncRNA在疾病、发育、细胞分化和先天免疫反应中起着至关重要的作用。本研究通过使用TopHat2软件和Cufflinks软件分析草鱼的转录组数据，鉴定了与免疫相关的长链非编码RNA。筛选出一个lncRNA序列，命名为ISG152-L2,它位于草鱼ISG152的上游。使用综合基因组学查看器(IGV)测定ISG152-L2和草鱼ISG152的同步表达。研究了ISG152-L2的共表达，并确定了包括草鱼ISG152在内的相关基因网络，功能富集分析表明，这些基因在免疫相关过程中功能富集。用poly(I:C)刺激时，ISG152-L2在被测组织(脑，眼，肠，鳃，心脏，肝胰腺，脾脏和肾脏)中上调。同时，ISG152-L2和ISG152在CIK细胞受到poly(I:C)刺激后均上调。双荧光素酶基因检测发现，CIK细胞中的ISG152-L2显著增强了ISG152启动子活性，并且这种增强取决于ISG152-L2的特定620～1 190 bp区域。免疫共沉淀试验表明，草鱼ISG152可以在体外IRF3相互作用。此外，isg152-l2过表达增加了CIK细胞中IRF3的蛋白质水平，而ISG152-L2的干扰则产生了相反的结果。总之，我们筛选了一个免疫相关的lncRNA,即ISG152-L2,它位于ISG152的上游，并通过诱导其启动子的活性，上调IRF3的蛋白表达水平来增强ISG152的表达。
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| 关键词 ：
长链非编码RNA,
ISG152-L2,
ISG152,
IRF3,
先天免疫,
鱼类
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| 基金资助:国家自然科学基金地区资助项目(32160872)； |
| [1] |
代江娜刘倩刘霄岩. TUG1在急性心肌梗死患者血清中的表达及其对心肌细胞凋亡的影响[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(1): 49-. |
| [2] |
潘金清 汤佳馨 周佳敏 沈小媛 叶祥生 谭筱江. 基于焦亡相关lncRNAs的肺鳞癌预后风险模型[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(6): 25-. |
| [3] |
刘浪蔡风彭源祥余波黎腾黄加裕陈钦灿万文兵廖琦. LncRNA SNHG1对软骨细胞损伤的保护作用及调节机制[J]. 实用临床医学, 2022, 23(2): 42-. |
| [4] |
晏阳邓勇志. 基于GEO数据库筛选心脏肥大差异表达mRNA及其网络构建[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(2): 42-. |
| [5] |
周春花 钟伟翔 陈金萍 欧阳珊 吴小平. 利用沉积物和水体的环境DNA检测鱼类物种多样性的差异[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2021, 45(6): 565-. |
| [6] |
郑华山 陈成辉 蔡亲平 林献科 李合. lncRNA CASC9通过调控miR-424-5p/SOX9分子轴对食管鳞状细胞癌细胞恶性生物学行为的影响[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(3): 18-. |
| [7] |
李银辉 胡海燕 丁家荣 朱超 袁继行 郭志勇. LncRNA-ATB在草酸钙结晶诱导的HK-2细胞损伤、增殖抑制和上皮-间质转化中的作用[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(3): 6-. |
| [8] |
张绍平徐怡. LncRNA DILC在胆囊癌中的表达及意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2020, 60(6): 33-. |
| [9] |
孙鑫鑫舒静许萍. 长链非编码RNA在肺纤维化中的作用研究进展[J]. 实用临床医学, 2020, 21(3): 104-. |
| [10] |
田玉生邹颜阳. FAM83H-AS1表达与结肠癌患者临床特征及预后的关系[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2020, 60(3): 39-. |
| [11] |
尹灿灿熊伟. 长链非编码RNA与口腔颌面部疾病关系的研究进展[J]. 实用临床医学, 2019, 20(2): 83-. |
| [12] |
王晓敏王友莲. 长链非编码RNA与免疫调节及风湿性疾病关系的研究进展[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2018, 58(6): 98-. |
| [13] |
匡荟芬胡春华孙丽丽吴根林陈苗. 鄱阳湖鱼类重金属积累特征及其健康风险评价[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2018, 42(6): 578-. |
| [14] |
刘艺欣贾宝辉黄兆豪蒋明菊. 脓毒症中的先天免疫、能量改变与自噬[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2018, 58(2): 92-. |
| [15] |
何云燕贾思远于善娟. 红细胞生成相关MiRNA和LncRNA研究进展[J]. 实用临床医学, 2017, 18(09): 91-. |
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