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草鱼(Ctenopharyngodon idella)长链非编码RNA ISG152-L2激活IRF3和ISG152的表达
南昌大学生命科学学院
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摘要 长链非编码RNA(lncRNA,非编码RNA≥200 bp)以前被认为是转录中的“噪音”。然而,近年来已经发现了相当多的具有重要功能的lncRNA。LncRNA在疾病、发育、细胞分化和先天免疫反应中起着至关重要的作用。本研究通过使用TopHat2软件和Cufflinks软件分析草鱼的转录组数据,鉴定了与免疫相关的长链非编码RNA。筛选出一个lncRNA序列,命名为ISG152-L2,它位于草鱼ISG152的上游。使用综合基因组学查看器(IGV)测定ISG152-L2和草鱼ISG152的同步表达。研究了ISG152-L2的共表达,并确定了包括草鱼ISG152在内的相关基因网络,功能富集分析表明,这些基因在免疫相关过程中功能富集。用poly(I:C)刺激时,ISG152-L2在被测组织(脑,眼,肠,鳃,心脏,肝胰腺,脾脏和肾脏)中上调。同时,ISG152-L2和ISG152在CIK细胞受到poly(I:C)刺激后均上调。双荧光素酶基因检测发现,CIK细胞中的ISG152-L2显著增强了ISG152启动子活性,并且这种增强取决于ISG152-L2的特定620~1 190 bp区域。免疫共沉淀试验表明,草鱼ISG152可以在体外IRF3相互作用。此外,isg152-l2过表达增加了CIK细胞中IRF3的蛋白质水平,而ISG152-L2的干扰则产生了相反的结果。总之,我们筛选了一个免疫相关的lncRNA,即ISG152-L2,它位于ISG152的上游,并通过诱导其启动子的活性,上调IRF3的蛋白表达水平来增强ISG152的表达。
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胡霁欢胡美玲史骁周鹏程常凯乐向阳徐小文
关键词 长链非编码RNAISG152-L2ISG152IRF3先天免疫鱼类    
    
基金资助:国家自然科学基金地区资助项目(32160872);
引用本文:   
胡霁欢胡美玲史骁周鹏程常凯乐向阳徐小文. 草鱼(Ctenopharyngodon idella)长链非编码RNA ISG152-L2激活IRF3和ISG152的表达[J]. 南昌大学学报(理科版), 2023, 47(3): 272-.
链接本文:  
https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/     或     https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/Y2023/V47/I3/272
 

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