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磁珠富集法筛选池蝶蚌微卫星分子标记 |
陶然;史建伍;邱齐骏;盛军庆;王军花;洪一江; |
南昌大学生命科学与食品工程学院; 江西抚州市水产科学研究所; |
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TAO Ran;SHI Jianwu;QIU Qijun;SHENG Junqin;WANG Junhua;HONG Yijiang |
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摘要 通过磁珠富集的方法分离池蝶蚌(Hyriopsis Schlegelii)的微卫星分子标记。将池蝶蚌基因组DNA酶切,连接Brown接头,采用PCR技术富集,与探针杂交后杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,再将这些片段洗脱,PCR扩增,克隆构建含有微卫星片段的"基因组文库",所得到的阳性克隆进行测序。从所获得的212个阳性克隆中选取110个进行测序,其中54.5%含有微卫星序列,80%的重复序列重复数在10以上,微卫星序列中21.4%为完美型。除探针中使用的AC、AG等重复单元外,还观察到CT、GA、ATG等重复序列。设计获得60对微卫星引物,合成其中的30对经PCR筛选,结果有10对引物扩增出多态性条带。该实验表明:磁珠富集法是获得池蝶蚌微卫星分子标记的一种有效的方法,同时,制备出的微卫星标记可为今后研究池蝶蚌分子遗传多样性提供有用的遗传标记。
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关键词 :
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池蝶蚌,
微卫星,
磁珠富集法
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基金资助: 国家公益性行业科研专项资助项目(HY200903028);江西省科技支撑基金资助项目(2009BNA07400,2010BNA07700);江西省农业厅农业新技术示范与推广资助项目(赣农计字[2010]230号);江西省科技落地计划资助项目(KJLD12001) |
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