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基于Autodock和蛇PLIγ设计短肽sPLA2抑制剂 |
钟立鹏;姚敏;乐贞;黄春洪; |
南昌大学基础医学院; |
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ZHONG Lipeng;YAO Min;LE Zhen;HUANG Chunhong |
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摘要 天然的分泌型磷脂酶A2(Secretory phospholipase A2,sPLA2)抑制蛋白主要是蛇磷脂酶A2抑制蛋白γ(Snake phospholipase A2inhibitor proteinγ,PLIγ)。通过分析华游蛇PLIγ序列的结构特点及活性区,设计短肽PLA2抑制剂。运用Autodock分子对接软件,分析短肽与sPLA2的相互作用,通过pH动态监测法验证其抑制活性。设计得到的CPGV肽可以与sPLA2的疏水性活性中心结合,该四肽对蛇毒sPLA2的活性抑制率为69.12%。通过生物信息学和分子对接模拟筛选,成功地设计了PLIγ的活性肽。
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关键词 :
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蛇磷脂酶A2抑制蛋白,
分泌型磷脂酶A2,
生物信息学,
分子对接
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基金资助: 国家自然科学基金(31260209);江西省科技支撑计划(20122BBG70091) |
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