5种蚌螨ITS2基因片段序列及其系统发育分析
吴浩彬; 程剑; 文春根; 谢彦海; 郭维
南昌大学生物科学系;
WU Hao-bin,CHENG Jian,WEN Chun-gen,XIE Yan-hai,GUO Wei(Department of Bioscience,Nanchang University,Nanchang 330031,China)
摘要 对5种蚌螨ITS2基因片段进行了序列测定,经比对后发现序列长度为258 bp(含gap);其中保守位点186个,可变位点57个,总变异率达到22.1%,种间变异率在7.4%~14.9%之间;转换位点11个,颠换位点18个,转换颠换比值为0.61。A,G,C,T4种碱基的平均含量分别为29.5%、17.2%、18.1%、35.2%,平均
关键词 :
系统发育 ,
ITS2基因 ,
蚌螨 ,
序列分析
Abstract :A nucleotide sequence analysis of ribosomal internal transcribed spacer 2(ITS2) gene fragment from five species unionicolid mites was performed.It was found that the aligned nucleotide fragment is 258 bp(including gap) in length,including 186 conserved si
Key words :
unionicolid mites
sequence analysis
ITS2 gene
phylogeny;
出版日期: 2011-04-28
引用本文:
吴浩彬; 程剑; 文春根; 谢彦海; 郭维. 5种蚌螨ITS2基因片段序列及其系统发育分析[J]. 南昌大学学报(理科版), 2011, 35(02): 1-.
WU Hao-bin,CHENG Jian,WEN Chun-gen,XIE Yan-hai,GUO Wei(Department of Bioscience,Nanchang University,Nanchang 330031,China). . , 2011, 35(02): 1-.
链接本文:
http://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/ 或 http://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/Y2011/V35/I02/1
[1]
侯喜洋;肖芳美;熊文芳;史建伍;吴娣;辜清;洪一江;. 池蝶蚌细胞色素P450 cDNA及其蛋白的序列分析 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2014, 38(04): 386-.
[2]
辛天蓉;阙生全;吴轩德;王雅瑜;邹志文;夏斌; . 桔全爪螨几丁质合成酶基因克隆与序列 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2014, 38(04): 395-.
[3]
吴浩彬;张丽红;文春根;郭维. 褶纹冠蚌内4种蚌螨的时空生态位分析 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2012, 36(03): 268-.
[4]
吴浩彬; 郭维; 文春根. 弯弓蚌螨(Unionicola arcuata)线粒体12 S rRNA基因的序列分析 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2011, 35(03): 1-.
[5]
林巧惠; 曾柳根; 刘芳兰; 盛军庆; 王军花; 龚贵如; 洪一江. 池蝶蚌(Hyriopsis Schlegelii)线粒体DNA COⅡ基因的序列分析 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2010, 34(02): 1-.
[6]
吴红松; 欧阳珊; 吴小平; 赵大显; 阮禄章. 基于ITS-1基因序列探讨许氏帆蚌和三角帆蚌的分类地位 [J]. 南昌大学学报(工科版), 2008, 30(03): 1-.
[7]
文春根; 焦玉坛; 胡宝庆. 光强与光色对3种寄生蚌螨趋光行为的影响 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2008, 32(02): 1-.
[8]
文春根; 胡宝庆; 徐毛喜; 朱志民. 褶纹冠蚌寄生蚌螨群落结构 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2005, 29(06): 1-.
[9]
谢院荣; 李汉全; 吴兰; 文春根; 朱志民. 三角帆蚌中寄生弯弓蚌螨空间分布型 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2003, 27(02): 1-.
[10]
文春根; 朱学春; 夏斌; 朱志民. 蚌螨对几种药物的敏感性试验 [J]. 南昌大学学报(理科版), 2002, 26(01): 1-.
[11]
张寿斌; 廖华; 黄呈辉; 李婉华; 谭庆瑜. 深圳地区手足病肠道病毒5′端非编码区部分基因克隆和序列分析 [J]. 南昌大学学报(医学版), 2002, 44(01): 1-.
[12]
陈国安; 袁利亚; 戴育成; 王文阁; 王艳飞; 贺福初. 人α2b-干扰素的基因克隆及序列分析 [J]. 南昌大学学报(医学版), 1998, 40(04): 1-.
[13]
文春根; 胡宝庆; 朱志民. 蚌螨寄生生态学研究 [J]. 南昌大学学报(理科版), 1996, 20(03): 1-.
[14]
张天堑; 何士勤; 周南南; 邹伟文. 中国南昌地区人、猪和鸭流感病毒流行病学研究 [J]. 南昌大学学报(医学版), 1995, 37(03): 1-.
[15]
涂努民. 稻螟中长期数量预测的时间序列分析法 [J]. 南昌大学学报(理科版), 1990, 14(01): 1-.