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| 基于生信、分子对接和分子动力学分析附子-酸枣仁配伍治疗胃癌的作用机制 |
| 蔡鹏钦 陈文政 常瑞雪 张睿洁 黄盛鸿 熊鸣峰 |
| 南昌大学第一附属医院中医科 南昌大学第一附属医院胃肠外科 南昌大学第一附属医院全科医学科 南昌大学十层脉研究所 中日友好医院江西医院 |
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摘要 目的 基于生物信息学、网络药理学、分子对接及分子动力学模拟，探究附子-酸枣仁配伍治疗胃癌的潜在分子机制。方法 整合基因表达综合数据库（GEO）与癌症基因组图谱（TCGA）胃癌数据集，利用差异表达分析与加权基因共表达网络分析筛选枢纽（Hub）基因；自TCMSP数据库获取中药活性成分并预测靶点；结合疾病靶点数据库进行交集分析，获得潜在作用靶点并进行富集分析；构建“成分-靶点-通路”网络筛选核心成分；采用分子对接与100 ns分子动力学模拟评估结合模式与稳定性。结果 共筛选出3个关键潜在靶点（ABCG2、MMP7、CCKBR）及245个中药-胃癌交叉靶点，主要富集于PI3K/AKT信号通路、FoxO信号通路等。确定去氧穿心莲内酯、德尔妥因、飞燕草苷和酸枣仁皂苷A为前4位核心活性成分。分子对接显示酸枣仁皂苷A与各靶点结合能均低于-7 kcal·mol-1，亲和力最强。分子动力学模拟进一步证实，酸枣仁皂苷A与ABCG2的结合自由能为-62.76 kcal·mol-1，体系稳定。结论 附子-酸枣仁配伍可能通过酸枣仁皂苷A、去氧穿心莲内酯和德尔妥因3种活性成分作用于ABCG2、MMP7、CCKBR等关键靶点，调节PI3K/AKT信号通路、FoxO信号通路等通路，对胃癌肿瘤干细胞、胃癌侵袭转移、不良预后和化疗耐药等产生影响，从而发挥对胃癌的治疗作用。
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| 关键词 ：
附子-酸枣仁配伍,
胃癌,
生物信息学,
网络药理学,
分子对接,
分子动力学模拟
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| 基金资助:国家自然科学基金资助项目（82560543）； 全职引进人才科研启动基金（RSC-0015）； |
| [1] |
陈功财 裴淑娟 魏里程 李思璇 刘洋 欧阳晓春 徐志晓 温剑峰 刘彬. 基于SEER数据库构建胃癌患者预后的预测模型[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2026, 66(1): 69-. |
| [2] |
邓雯 杨安树 陈红兵. 黄豆黄素与大豆球蛋白的相互作用机制及其对蛋白结构的影响[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2025, 49(4): 373-. |
| [3] |
辜云帆 曹毅 杨芳. 进展期胃癌根治术中部分大网膜切除的有关争议与研究进展[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2025, 65(3): 86-. |
| [4] |
张云鹏邓燕. 生物信息学法鉴定氧诱导视网膜病变中乳酸代谢相关基因及其验证[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2025, 65(3): 21-. |
| [5] |
张振赵新丽周星琦杨玉梅李锋李娴. 口腔鳞状细胞癌中铜死亡基因的表达及其临床意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2025, 65(2): 14-. |
| [6] |
任崇阳翁若欣吴文波郑月慧凌舒艺. 基于网络药理学及分子对接技术分析固肾安胎丸治疗先兆流产的作用机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2025, 65(1): 12-. |
| [7] |
魏军周联明蒋叶平. NEDD8在胆囊癌发生发展中的作用机制研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2025, 65(1): 21-. |
| [8] |
王丹丹 李雪芹 谢庆斌 翟慧兰 谢芬 胡睿 江璐 江蕾 杨英妹. 中药穴位贴敷在胃癌术后患者胃肠道功能恢复中的应用[J]. 实用临床医学, 2024, 25(6): 71-. |
| [9] |
胡智 周凌烨 胡锦芳 刘建明. 基于网络药理学及实验验证探讨大黄的抗胆汁淤积作用机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(6): 8-. |
| [10] |
吴紫云 汪嵘嵘 俞快 谢玉芬 吴佳慧 刘晓萍 周伯宣 熊海蔚. 聚蛋白聚糖促进乳腺癌进展的作用及其机制研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(5): 1-. |
| [11] |
杨艳婷高瑞宋汉歌. 幽门螺杆菌定植和铁死亡基因表达与胃癌临床病理及预后的关系[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(4): 51-. |
| [12] |
胡家李蕾殷爱红杨颖. 基于SPR-MS联合法鉴定Mas的互作蛋白[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(4): 7-. |
| [13] |
胡震 赵绍基 祁玉忠 王光熙 孙开宇 吴文辉. 基于免疫相关基因标记的胃癌预后预测模型的构建和验证[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(2): 1-. |
| [14] |
潘希望邱模竞郑林林杨新博徐晨李太原胡家萍. 生物信息学方法筛选结肠癌相关lncRNA-miRNA网络及其细胞水平的功能验证[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2024, 64(1): 6-. |
| [15] |
欧阳秀芳赵宁付尚淼孙智坚钱克俭陶文强. 肾缺血再灌注致肺损伤关键基因Alox5ap的筛选及其表达与功能验证[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(6): 8-. |
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