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| 5-氟尿嘧啶介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因筛选 |
| 杨丰帅 彭玲 邱东达 杨运泉 陈石林 周厚吾 |
| 长沙市第一医院胃肠外科 长沙市第一医院外科护理 |
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摘要 目的 探究5-氟尿嘧啶(5-FU)介导氧化应激治疗结肠癌的关键基因。方法 从GSE193865和GSE164742数据集中筛选5-FU介导氧化应激治疗结肠癌的共同差异基因(DEGs),并对共同DEGs进行功能富集，构建PPI网络筛选关键基因。基于TCGA数据集和GSE164742数据集，分析关键基因在结肠癌中的表达、相关性及其与预后的关系。利用分子对接实验验证5-FU对关键基因的靶向作用。结果 筛选出29个共同DEGs;这29个基因在功能上与P53信号通路、细胞周期等6条信号通路和有丝分裂细胞周期过程、微管等10项功能有关。PPI网络分析筛选得到7个关键基因(AURKA、CDCA8、CCNB1、KIF14、SPAG5、BUB1B和KIF20A);这7个关键基因均在结肠癌中高表达，且5-FU可显著抑制结肠癌细胞中这7个关键基因的高表达(均P<0.05);在TCGA和GSE193865数据集中这7个关键基因的表达之间均具有较好的相关性(r>0.6,均P<0.05)。这7个关键基因的高表达与结肠癌患者总体生存不良密切相关(Logrank P<0.05)。5-FU与这7个关键基因之间存在靶向作用。结论 成功筛选7个与5-FU介导氧化应激治疗结肠癌相关的关键基因。
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| 关键词 ：
5-氟尿嘧啶,
结肠癌,
氧化应激,
生物信息学,
关键基因
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| 基金资助:长沙市科学技术局指导性科技项目(kzd2001091)； |
| [1] |
刘莉 童国勇 余周庆 朱彬 张宏谧. 南方红豆杉水提物通过氧化应激和线粒体损伤影响口腔鳞癌细胞CAL27的增殖和凋亡[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(4): 19-. |
| [2] |
杨从影 罗江 唐莉华1 黄学娣 孙龙华. 基于网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊治疗结直肠癌作用机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(3): 5-. |
| [3] |
陈铖邓真真. 维持性血液透析患者硫酸对甲酚水平与微炎症、氧化应激的关系[J]. 实用临床医学, 2023, 24(3): 5-. |
| [4] |
徐文珍邓泽元李红艳. TNF-α联合H2O2诱导对大鼠心肌细胞氧化应激和炎症损伤的影响[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2023, 47(2): 175-. |
| [5] |
欧阳永灏易思清辛万鹏孙根方康涂书举肖卫东. m6A阅读器IGF2BP1在胰腺癌中的表达及意义[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(1): 27-. |
| [6] |
田捷陈吉涛邱美杨举良刘飞. Copines蛋白家族在肾透明细胞癌中的潜在预后价值[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2023, 63(1): 1-. |
| [7] |
和斌 康乐 瞿晓燕 杨尚 刘楚颖 闫蔷. 子宫腺肌症患者血清中Sirt6和氧化应激指标水平及其相关性分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(6): 21-. |
| [8] |
汤鑫冯德伟李玉洁. 腹腔镜下阑尾切除术对穿孔性阑尾炎患者围术期氧化应激反应的影响[J]. 实用临床医学, 2022, 23(6): 18-. |
| [9] |
潘金清 汤佳馨 周佳敏 沈小媛 叶祥生 谭筱江. 基于焦亡相关lncRNAs的肺鳞癌预后风险模型[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(6): 25-. |
| [10] |
张森 饶思静 洪芬芳 杨树龙. 基于网络药理学方法研究决明子活性成分治疗动脉粥样硬化的分子机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(4): 1-. |
| [11] |
王维 曹亦楠 刘嘉莉 赵晓东 魏慧军 魏明清 马亚茹 黄存生 薛旭升. 基于多重生物信息学分析阿尔茨海默病的调控网络及相关机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(3): 1-. |
| [12] |
薛瑾 陈应强. Nrf2/HO-1信号通路在肝脏相关疾病中的研究进展[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(3): 88-. |
| [13] |
孔令军赵真黄子丽. 输尿管软镜钬激光碎石术治疗单侧输尿管上段结石的临床效果[J]. 实用临床医学, 2022, 23(3): 28-. |
| [14] |
李彬彬 王民 田勇 楚清锋. 依帕司他联合α-硫辛酸治疗老年糖尿病周围神经病变的临床效果[J]. 实用临床医学, 2022, 23(2): 16-. |
| [15] |
张雅楠 李浩东 章芯怡 韩杰 黄起壬. 白脂素对高浓度葡萄糖诱导心肌细胞损伤的保护作用及机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(5): 24-. |
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