肺腺癌预后相关坏死性凋亡基因标志物的构建及验证

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摘要目的构建肺腺癌(LUAD)预后相关坏死性凋亡基因标志物并对其进行评估。方法 KEGG数据库筛选坏死性凋亡相关基因(NRGs);TCGA和GEO数据库中分别下载LUAD样本和正常样本的RNA测序及其相应临床数据，并以TCGA数据集作为训练队列，以GEO数据集作为验证队列，对筛选的NRGs进行差异和功能富集分析；单因素Cox及Lasso Cox回归分析构建NRGs的LUAD预后标志物；采用Kaplan-Meier生存分析、timeROC分析、多因素Cox回归分析和临床列线图评估该预后标志物；以GEO数据集(GSE31210)外部验证该预后标志物。结果筛选获得159个NRGs;在训练队列中鉴定出26个差异表达的NRGs(DENRGs);富集分析发现DENRGs主要参与坏死性凋亡和NOD样受体等信号通路；构建由6个NRGs(PLA2G4F、IL33、TLR4、RNF103.CHMP3、ALOX15、IL1A)组成的预后标志物；生存分析显示高风险组总体生存率(OS)明显低于低风险组(log-rank P<0.001);该预后标志物预测1年、3年和5年OS的AUC分别为0.672、0.631和0.624,且与LUAD患者OS显著相关(HR:2.30,95%CI:1.30～4.00,P<0.01);建立的列线图能较好地预测LUAD患者的生存；验证队列的分析结果与训练队列一致。结论成功构建一种新的NRGs预后标志物，其可用于预测LUAD患者的预后，且该预后标志物的预测能力良好。

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	罗亭欧阳锦余石群曾凡凡高丽云黄邵鑫汪鑫

关键词 ：肺腺癌, 坏死性凋亡, 预后, 标志物

基金资助:国家自然科学基金(81360447)；江西省自然科学基金(20202BAB206067,20192ACB20019)；中国博士后科学基金项目(2019M652334)；

引用本文:

罗亭欧阳锦余石群曾凡凡高丽云黄邵鑫汪鑫. 肺腺癌预后相关坏死性凋亡基因标志物的构建及验证[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(5): 1-.

链接本文:

https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xbyxb/CN/ 或 https://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xbyxb/CN/Y2022/V62/I5/1