|
|
|
| 基于网络药理学方法研究决明子活性成分治疗动脉粥样硬化的分子机制 |
| 张森 饶思静 洪芬芳 杨树龙 |
| 南昌大学医学部基础医学院生理教研室 南昌大学医学部实验教学中心 南昌大学抚州医学院生理教研室 南昌大学抚州医学院慢性病研究重点实验室 |
|
|
|
|
摘要 目的 应用网络药理学方法初步研究决明子抗动脉粥样硬化可能的有效活性成分和潜在靶点。方法 通过TCMSP和SwissTargetPrediction数据库收集决明子主要活性成分及其潜在靶点，GeneCards、OMIM、TTD and DrugBank数据库挖掘AS相关靶点。利用R语言筛选药物与疾病间的交集靶点并绘制Venny图。应用String平台构建蛋白质相互作用网络，Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析。基于DAVID网站完成富集分析，并利用R语言使结果可视化。利用Cytoscape 3.7.2软件建立决明子活性成分-靶点-通路网络，并分别生成14个活性成分作用网络。结果 TCMSP数据库中共检索到aloe-emodin、Obtusin、quinizarin等决明子有效活性成分14个，有效活性成分潜在靶点542个。与挖掘到的574个动脉粥样硬化靶点取交集，共获得99个共同靶点。经Cytoscape 3.7.2软件拓扑分析后筛选出前20位核心靶点，包括SRC、JUN、MAPK8、MAPK14、CTNNB1等。GO富集分析共获得平滑肌细胞增殖的正调控、炎症反应等340个生物过程；KEGG通路富集分析得出104条通路，涉及VEGF、TNF和花生四烯酸代谢等通路。蒽醌类化合物主要作用于IL-17、TNF、VEGF、动脉粥样硬化流体剪切力和脂质代谢等靶点和通路；苯并吡喃酮类化合物主要作用于糖尿病性心肌病、动脉粥样硬化流体剪切力、VEGF、血小板活化、花生四烯酸代谢等靶点和通路。结论 决明子治疗动脉粥样硬化具有多成分、多靶点、多通路的特点，主要通过影响炎症反应、氧化应激、血管新生和斑块稳定性等病理生理过程发挥治疗AS的作用。
|
|
| 关键词 ：
动脉粥样硬化,
决明子,
生物信息学,
网络药理学
|
|
|
| 基金资助:国家自然科学基金(81660751,81660151,81260504)； 江西省自然科学基金(20212BAB206092)； 江西省教育厅科技研究重点项目(GJJ218104)； |
| [1] |
王维 曹亦楠 刘嘉莉 赵晓东 魏慧军 魏明清 马亚茹 黄存生 薛旭升. 基于多重生物信息学分析阿尔茨海默病的调控网络及相关机制[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2022, 62(3): 1-. |
| [2] |
李佳容 缪顺莉 赵舷宏 邓海霞 陈更新. 木香-砂仁药对治疗功能性消化不良的分子机制探讨[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(6): 24-. |
| [3] |
万函 王秀芬 杨美雯 杨蓓 吴磊 洪芬芳 杨树龙. 一氧化氮信号通路与动脉粥样硬化[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(5): 72-. |
| [4] |
杜尚广 涂序堂 熊敏 余波 曹文艳 徐雅楠 罗火林. 木薯MeSAD基因的电子克隆与生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2021, 45(4): 377-. |
| [5] |
涂成城陶峰储斌陈红波. 子痫前期相关miR-23b-5p靶基因的预测及生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 1-. |
| [6] |
邓剑雄钟方炎顾伟国邱峰. 跨膜丝氨酸蛋白酶2与肺腺癌和肺鳞癌预后的关系[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2021, 61(4): 35-. |
| [7] |
钟方炎 邓剑雄 赖军明 沈若妍 林红 罗辉. GINS家族基因在肾透明细胞癌中的表达特点及预后价值[J]. 实用临床医学, 2021, 22(3): 1-. |
| [8] |
关华 徐浩 相奥琪 徐礼鲜 余琦 徐仓宝. 可可粉抑制雌性ApoE-/-小鼠主动脉动脉粥样硬化斑块的形成[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2020, 60(5): 1-. |
| [9] |
王娜 李燕萍. 橙色红曲菌Rab蛋白家族的生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2020, 44(4): 332-. |
| [10] |
王梦琦陈玲姚利阳陈博璐许恒毅. 经口暴露生决明子对雌性小鼠肝脏的影响[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2019, 43(5): 483-. |
| [11] |
陈东启余勃陆豫. RACE法克隆黑曲霉NCU-317中α-L-鼠李糖苷酶基因与生物信息学分析[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2019, 43(5): 489-. |
| [12] |
邓施璐龙远春张兵张欣邓泽元. 决明子多糖含量测定方法[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2019, 43(3): 241-. |
| [13] |
汪小英彭维杰罗丹. TRPV1的血管生物学作用及与血管性疾病关系的研究进展[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2018, 58(6): 81-. |
| [14] |
张爽刘相城胡姣月刘春柏李晶晶. 鸢尾素对ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化形成的影响及机制研究[J]. 南昌大学学报（医学版）, 2018, 58(5): 1-. |
| [15] |
张荣伟余乐张秀灵范洁刘念邱晓娟纪丽献段新旺. 系统性红斑狼疮合并动脉粥样硬化与外周血维生素D水平的相关性分析[J]. 实用临床医学, 2018, 19(4): 1-. |
|
|
|
|
