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| 应用生物信息学探索神经母细胞瘤转移的关键基因 |
| 张守华 孟肖振 邹海波 冯丹 李科浩 李匡凡 占敏 徐晗 |
| 江西省儿童医院普通外科 南昌大学医学部 |
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摘要 目的 利用生物信息学手段分析神经母细胞瘤(NB)基因表达数据集，挖掘和NB转移相关的关键基因。方法 基于GEO数据库中的NB数据集GSE112447,利用在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因，对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析。通过STRING数据库构建差异表达基因的蛋白质互作网络(PPI),分别应用Cytoscape中的MCC、DMNC和Stress算法筛选出前15个候选关键基因，取交集确定关键基因。最后利用UCSC Xena数据库分析关键基因表达与NB患者预后的相关性。结果 共筛选出435个在NB转移和原发肿瘤组织间差异表达的基因，其中表达上调基因296个，表达下调基因139个。GO分析显示，差异表达基因与细胞黏附，趋化作用，炎症反应和补体激活等过程有关。KEGG通路分析显示，差异表达基因主要参与PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路和造血细胞调控信号通路等。唯一关键基因CCNB1的表达水平与NB患者的预后相关，其低表达与高生存率呈正相关(P<0.05)。结论 CCNB1基因可能在NB转移过程中起重要作用，且与患者预后相关，可作为NB诊疗的新生物标志物。
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| 关键词 ：
生物信息学,
神经母细胞瘤,
肿瘤转移,
关键基因,
预后分析
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| 基金资助:江西省卫健委科技计划项目(202210069)； 江西省科技厅应用培育计划(20212BAG70003)； |
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