鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码

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摘要探讨DNA条形码分子标记作为华溪蟹属(Sinopotamon)淡水蟹类辅助分类工具的可行性。选取分布于鄱阳湖流域的6种华溪蟹属淡水蟹类78个样本,采用线粒体COI和16SrRNA基因片段以及ITS2核基因片段,作为分子标记,结合GenBank数据库中同属序列片段,经DNA提取、引物筛选、PCR扩增、产物纯化测序及测序数据处理和分析,在计算得到的遗传距离和所构建系统发生树进行华溪蟹DNA条形码标准基因的选择。在本实验涉及的淡水蟹类个体及类群的识别上,16SrRNA和ITS2基因片段不适宜作为DNA条形码标准基因,而COI基因片段结合GenBank部分华溪蟹属序列数据分析,可区分本次研究所涉及的75%的物种。以线粒体COI基因片段为DNA条形码标准序列,可作为华溪蟹属淡水蟹类物种鉴定的辅助分类工具。

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关键词 ：鄱阳湖流域, 华溪蟹属, DNA条形码, COI

基金资助:

国家自然科学基金项目(81260257,81160207,31460156,31560179);江西省自然科学基金(20132BAB205059);江西省医学科研项目(20122025);江西省教育厅项目(GJJ12084);南昌大学研究生创新专项资金(CX2015180)

引用本文:

徐武杰；邹节新；白俊；朱春潮；石林波；张小燕；张萌；汪雁；周宪民. 鄱阳湖流域华溪蟹属DNA条形码[J]. 南昌大学学报（理科版）, 2015, 39(04): 402-.
XU Wujie;ZOU Jiexin;BAI Jue;ZHU Chuncao;SHI Linbo;ZHANG Xiaoyan;ZHANG Meng;WANG Yan;ZHOU Xianmin. . , 2015, 39(04): 402-.

链接本文:

http://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/ 或 http://qks.ncu.edu.cn/Jwk_xblxb/CN/Y2015/V39/I04/402